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（グレーの背景色）は、「渋沢関係略年譜」を参考のために表示しています。この社史に掲載されている年表項目ではありません。
| 年 | 月日 | 事項 | 年表種別 |
|---|---|---|---|
| 昭和18年（1943） | - | 【渋沢敬三】大東亜会議に来日のスバス・チャンドラ・ボース、約4週間綱町邸に逗留。 | 渋沢関係略年譜 |
| 10月 | 軍需会社法公布(1943.12施行) | 業界・一般社会事項 | |
| 11月 | 満州万有製薬株式会社設立(奉天市鉄西四区衛工街201) | 当社事項 | |
| - | 目黒工場、漁業組合・芸妓組合が報国隊として生産奉仕 | 当社事項 | |
| 昭和19年（1944） | - | 【竜門社】機関誌『竜門雑誌』669号を発行、以後休刊する。岩波書店より『渋沢栄一伝記資料』第1巻が刊行される。【渋沢敬三】結城日銀総裁辞任につき、日銀総裁に就任。総裁時代一度も東京を離れず。 | 渋沢関係略年譜 |
| 1月 | 日本医薬品統制株式会社設立 | 業界・一般社会事項 | |
| 1月 | 朝日新聞紙上にペニシリンの記事掲載「チャーチル命拾ひ」 | 業界・一般社会事項 | |
| 1月 | ペニシリン委員会発足 | 業界・一般社会事項 | |
| 3月 | 「ネスボサン」、「バンカイン」の製造を目黒工場から岡崎工場(久後崎)へ移転 | 当社事項 | |
| 5月 | 東京医薬品協会設立 | 業界・一般社会事項 | |
| 6月 | 資本金、300万円に増資 | 当社事項 | |
| 7月 | サイパン島玉砕 | 業界・一般社会事項 | |
| 8月 | 大阪府医薬品協会設立 | 業界・一般社会事項 | |
| 8月 | 学徒動員令、女子挺身勤労令公布 | 業界・一般社会事項 | |
| 11月 | 目黒工場でペニシリンの生産を開始 | 当社事項 | |
| 12月 | 第7回ペニシリン委員会にペニシリン精製液を提出 | 当社事項 | |
| 12月 | ペニシリンの日本名を「碧素」と決定 | 業界・一般社会事項 | |
| - | ワックスマン(米)、ストレプトマイシンを発見 | 業界・一般社会事項 | |
| 昭和20年（1945） | - | 【竜門社】曖依村荘を政府に寄贈する。空襲により曖依村荘内の建物の多くを焼失する。【渋沢敬三】幣原喜重郎より組閣本部に招かる。新木、山際正道と相談、大蔵大臣受諾。親任。 | 渋沢関係略年譜 |
| 1月 | 万有薬品株式会社を吸収 | 当社事項 | |
| 1月 | 資本金、318万円に増資 | 当社事項 | |
| 2月 | ペニシリン完成品を陸軍軍医学校に提出 | 当社事項 | |
| 2月 | 米英ソのヤルタ会談開く | 業界・一般社会事項 |
