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（グレーの背景色）は、「渋沢関係略年譜」を参考のために表示しています。この社史に掲載されている年表項目ではありません。
| 年 | 月日 | 事項 | 年表種別 |
|---|---|---|---|
| 平成16年（2004） | - | 【渋沢史料館】「日米実業史競」セントルイス展開催。 | 渋沢関係略年譜 |
| 10月13日 | リニューアルされた8000系車両が営業運転開始 | [当社] | |
| 10月23日 | 新潟県中越地震発生 | [業界・一般] | |
| 11月1日 | 高松駅など10駅7運転区所にサービス介助士2級の資格者17名を配置 | [当社] | |
| 11月2日 | プロ野球へ50年ぶりの新規参入球団「東北楽天イーグルス」誕生 | [業界・一般] | |
| 平成17年（2005） | - | 【竜門社】晩香廬、青淵文庫が国の重要文化財に指定される。【渋沢史料館】「日米実業史競」東京展開催。 | 渋沢関係略年譜 |
| 2月1日 | ホームページでの列車運行情報の提供開始 | [当社] | |
| 2月25日 | 丸亀駅(高架駅)に設置したエレベーター使用開始 | [当社] | |
| 3月1日 | 一部の特急「いしづち」にレディースシートを設定 | [当社] | |
| 3月1日 | 特急列車の指定席を全面禁煙 | [当社] | |
| 3月12日 | 土讃線大杉駅が大豊町の地域振興施設「とまレール大杉」として再建 | [当社] | |
| 3月25日 | 愛知万博「愛・地球博」が開幕(9月25日まで) | [業界・一般] | |
| 4月25日 | 福知山線脱線事故発生 | [業界・一般] | |
| 4月29日 | 日本初のプロ野球独立リーグ「四国アイランドリーグ」開幕 | [業界・一般] | |
| 10月1日 | 予讃線アンパンマン列車に「アンパンマンシート」を導入 | [当社] | |
| 10月1日 | 日本道路公団民営化 | [業界・一般] | |
| 11月22日 | JR四国で初めて津波防災を目的とした防災訓練を牟岐線で実施 | [当社] | |
| 12月25日 | 羽越本線脱線事故発生 | [業界・一般] | |
| 平成18年（2006） | - | 【竜門社】財団法人渋沢栄一記念財団が創立120年を迎える。 | 渋沢関係略年譜 |
| 3月1日 | 駅番号表示(駅ナンバリング)をJRグループで初めて導入 | [当社] | |
| 5月25日 | 1500型気動車を徳島地区に導入 | [当社] | |
| 7月14日 | 日本銀行が5年4ヵ月ぶりに「ゼロ金利政策」解除 | [業界・一般] | |
| 7月27日 | 高松、坂出、松山、徳島、高知の5駅にAEDを設置 | [当社] |
