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（グレーの背景色）は、「渋沢関係略年譜」を参考のために表示しています。この社史に掲載されている年表項目ではありません。
| 年 | 月日 | 事項 | 年表種別 |
|---|---|---|---|
| 昭和13年（1938） | - | 【渋沢敬三】国民貯蓄奨励委員会委員。 | 渋沢関係略年譜 |
| 8月 | 高津分工場内に卵胞ホルモン抽出工場を併設 | 当社事項 | |
| 11月 | 年2回決算を年1回決算(11月期)に変更 | 当社事項 | |
| 12月 | 全国医薬品原料配給統制会設立 | 業界、一般事項 | |
| 昭和14年（1939） | - | 【竜門社】財団法人渋沢青淵翁記念会と共催で「青淵先生生誕百年記念祭」を挙行する。日本実業史博物館建設地鎮祭を挙行する。 | 渋沢関係略年譜 |
| 5月 | 鳥山処理所を開設 | 当社事項 | |
| 7月 | 国民徴用令公布 | 業界、一般事項 | |
| 8月 | 第五改正日本薬局方大改正(キノホルム収載) | 業界、一般事項 | |
| 9月 | 第2次世界大戦勃発 | 業界、一般事項 | |
| 10月 | 価格等統制令公布 | 業界、一般事項 | |
| 11月 | 天然色学術映画「生物とホルモン」全2巻を制作 | 当社事項 | |
| 昭和15年（1940） | - | 【竜門社】第100回会員総会並に記念展観を開催する。 | 渋沢関係略年譜 |
| 1月 | 日米通商条約失効、対日禁輸 | 業界、一般事項 | |
| 5月 | 東部医薬品中央配給統制組合設立 | 業界、一般事項 | |
| 6月 | 鳥山処理所を閉鎖 | 当社事項 | |
| 6月 | 芽室出張所を開設 | 当社事項 | |
| 8月 | 中国・北京に支社「北京臓器薬廠有限公司」を開設 | 当社事項 | |
| 9月 | 日独伊三国同盟調印 | 業界、一般事項 | |
| 11月 | 芝浦出張所を開設 | 当社事項 | |
| 11月 | 大日本産業報国会設立 | 業界、一般事項 | |
| 12月 | 日本新薬(株)、国産サントニンを発売 | 業界、一般事項 | |
| 昭和16年（1941） | - | 【渋沢敬三】全国貯蓄銀行協会会長に就任。第一銀行副頭取に就任。 | 渋沢関係略年譜 |
| 2月 | 医薬品統制規則公布 | 業界、一般事項 | |
| 3月 | 学術部を新設(製品拡張活動を開始) | 当社事項 |
