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（グレーの背景色）は、「渋沢関係略年譜」を参考のために表示しています。この社史に掲載されている年表項目ではありません。
| 年 | 月日 | 事項 | 年表種別 |
|---|---|---|---|
| 平成10年（1998） | - | 【渋沢史料館】渋沢史料館をリニューアルオープンする。 | 渋沢関係略年譜 |
| 10月1日 | 診療報酬改定......歯科1.5%・調剤1.5%引上げ | 内外事情 | |
| 10月29日 | 三共ファルマ リサーチ インスティテュートを設立(アメリカ・サンディエゴ) | 当社の歩み | |
| 11月16日 | テレビ会議システム稼働 | 当社の歩み | |
| 11月16日 | 農業科学研究所に環境化学研究グループを設置 | 当社の歩み | |
| 12月1日 | 一般薬開発部、一般薬営業部およびヘルスケア部を統合しヘルスケア部を新設・グループ制を導入(医薬営業本部から分離・独立) | 当社の歩み | |
| 12月31日 | 社債の転換により資本金552億415万円となる | 当社の歩み | |
| - | ・和歌山カレー事件 | 内外事情 | |
| 平成11年（1999） | - | 【竜門社】晩香廬(大正6年竣工)の保存修理工事を終了する。 | 渋沢関係略年譜 |
| 1月1日 | 育児短時間勤務制度を新設 | 当社の歩み | |
| 1月7日 | 医療保険福祉審議会制度企画部会、薬剤定価・給付基準額制度(日本版参照価格制度)に関する意見書を提出 | 内外事情 | |
| 1月13日 | 日薬連、市場価格・購入価給付制度導入に関する意見書を提出 | 内外事情 | |
| 1月14日 | 製薬協、医薬産業政策研究会を設置 | 内外事情 | |
| 1月28日 | 厚生省、一般用医薬品の販売規制緩和を発表(11.3.31実施) | 内外事情 | |
| 2月1日 | 人事部に均等雇用管理室を新設 | 当社の歩み | |
| 2月28日 | 臓器移植法施行後初の脳死移植 | 内外事情 | |
| 3月1日 | 第100回創立記念日(記念式典、物故者慰霊祭、記念祝賀会を実施、於・本社、事業所) | 当社の歩み | |
| 3月1日 | 三共企業行動憲章を制定 | 当社の歩み | |
| 3月1日 | 三共研究所ホームページを開設 | 当社の歩み | |
| 3月16日 | 医薬情報第一部くすり相談室を製品情報・くすり相談室に改称 | 当社の歩み | |
| 3月16日 | 医薬開発第一部・第二部・第三部および国際開発部を医薬開発促進部、臨床研究部および臨床開発部に再編成 | 当社の歩み | |
| 3月16日 | 医薬開発管理部を廃止し業務の一部を薬事部に統合して薬事業務部を新設 | 当社の歩み |
